Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cux1P53564 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux1P53564 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux1P53564 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms