Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms