Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3P52483 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms