Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnfP51944 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnfP51944 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnfP51944 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms