Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms