Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Tmod1P49813 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Tmod1P49813 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Tmod1P49813 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Tmod1P49813 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Tmod1P49813 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Tmod1P49813 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Tmod1P49813 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Tmod1P49813 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Tmod1P49813 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Tmod1P49813 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Tmod1P49813 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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