Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnni3P48787 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms