Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms