Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rfx2P48379 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rfx2P48379 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms