Protein–RNA interactions for Protein: P47801

Emp1, Epithelial membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp1P47801 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emp1P47801 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp1P47801 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms