Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf1P46099 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms