Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sipa1P46062 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms