Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlx1P43345 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms