Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms