Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pbx1P41778 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pbx1P41778 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbx1P41778 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbx1P41778 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbx1P41778 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbx1P41778 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbx1P41778 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbx1P41778 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbx1P41778 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbx1P41778 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbx1P41778 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbx1P41778 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbx1P41778 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbx1P41778 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pbx1P41778 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms