Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Tnfsf9P41274 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tnfsf9P41274 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnfsf9P41274 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnfsf9P41274 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnfsf9P41274 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnfsf9P41274 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnfsf9P41274 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tnfsf9P41274 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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