Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VhlP40338 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VhlP40338 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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