Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf1P39428 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms