Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtlP38585 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TtlP38585 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TtlP38585 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TtlP38585 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TtlP38585 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtlP38585 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtlP38585 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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