Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms