Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms