Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms