Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab23P35288 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab23P35288 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab23P35288 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab23P35288 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab23P35288 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab23P35288 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab23P35288 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab23P35288 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab23P35288 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab23P35288 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab23P35288 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rab23P35288 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rab23P35288 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rab23P35288 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rab23P35288 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms