Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rab5cP35278 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rab5cP35278 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab5cP35278 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab5cP35278 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab5cP35278 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab5cP35278 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab5cP35278 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5cP35278 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rab5cP35278 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5cP35278 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rab5cP35278 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rab5cP35278 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5cP35278 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5cP35278 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab5cP35278 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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