Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms