Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnar1P33896 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnar1P33896 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms