Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola1P33609 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola1P33609 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pola1P33609 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola1P33609 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola1P33609 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms