Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms