Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Notch4P31695 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Notch4P31695 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms