Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa10P31310 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms