Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms