Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp1P29452 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp1P29452 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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