Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HexaP29416 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HexaP29416 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HexaP29416 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HexaP29416 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HexaP29416 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HexaP29416 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HexaP29416 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HexaP29416 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HexaP29416 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HexaP29416 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HexaP29416 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HexaP29416 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HexaP29416 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HexaP29416 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HexaP29416 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HexaP29416 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HexaP29416 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms