Protein–RNA interactions for Protein: P29391

Ftl1, Ferritin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftl1P29391 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ftl1P29391 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ftl1P29391 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms