Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms