Protein–RNA interactions for Protein: P29121

Pcsk4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk4P29121 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk4P29121 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk4P29121 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms