Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PtprmP28828 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprmP28828 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprmP28828 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprmP28828 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprmP28828 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprmP28828 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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