Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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RxrgP28705 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RxrgP28705 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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