Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RxraP28700 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxraP28700 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxraP28700 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxraP28700 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxraP28700 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms