Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Etv4P28322 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Etv4P28322 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Etv4P28322 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms