Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms