Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms