Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms