Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav1P27870 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms