Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpbP27790 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CenpbP27790 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpbP27790 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpbP27790 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms