Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2afxP27661 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2afxP27661 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2afxP27661 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms