Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rpl3P27659 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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