Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xrcc5P27641 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Xrcc5P27641 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Xrcc5P27641 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Xrcc5P27641 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Xrcc5P27641 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Xrcc5P27641 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Xrcc5P27641 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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