Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms