Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms